Чтобы удалить модуль в git нужно:

  1. Удалить секцию в .gitmodules.
  2. Удалить секцию из .git/config.
  3. Выполнить:
    _x000D_git add .gitmodules_x000D_git rm --cached <путь_к_модулю>
  4. Удалить папку .git/modules/<путь_к_модулю>.
  5. Удалить папку с модулем.
  6. Закомитить.